MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 52970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015387	GGC	2	6	215196	215201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949753
5002	NC_015387	GGC	2	6	215289	215294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949753
5003	NC_015387	CTT	2	6	215318	215323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949753
5004	NC_015387	GGTTG	2	10	215384	215393	0 %	40 %	60 %	0 %	328949754
5005	NC_015387	CTG	2	6	215430	215435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949754
5006	NC_015387	CCT	2	6	215447	215452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949754
5007	NC_015387	CTG	2	6	215505	215510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949754
5008	NC_015387	GCC	2	6	215543	215548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949754
5009	NC_015387	GC	3	6	215553	215558	0 %	0 %	50 %	50 %	328949754
5010	NC_015387	CGC	2	6	215591	215596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949754
5011	NC_015387	CCG	2	6	215635	215640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949754
5012	NC_015387	CTC	2	6	215664	215669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949754
5013	NC_015387	TCT	2	6	215671	215676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949754
5014	NC_015387	GTG	2	6	215699	215704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949755
5015	NC_015387	GCG	2	6	215715	215720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949755
5016	NC_015387	CGC	2	6	215737	215742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949755
5017	NC_015387	CGG	2	6	215762	215767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949755
5018	NC_015387	GAG	2	6	215825	215830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949755
5019	NC_015387	AGCC	2	8	215836	215843	25 %	0 %	25 %	50 %	328949755
5020	NC_015387	AGC	2	6	215847	215852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949755
5021	NC_015387	GTG	2	6	215870	215875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949755
5022	NC_015387	ACG	2	6	215877	215882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949755
5023	NC_015387	GC	3	6	215895	215900	0 %	0 %	50 %	50 %	328949755
5024	NC_015387	TGG	2	6	215934	215939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949755
5025	NC_015387	CCA	2	6	215955	215960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949755
5026	NC_015387	CGCT	2	8	215961	215968	0 %	25 %	25 %	50 %	328949755
5027	NC_015387	CCT	2	6	215995	216000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949755
5028	NC_015387	CG	3	6	216005	216010	0 %	0 %	50 %	50 %	328949755
5029	NC_015387	CGC	2	6	216032	216037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949755
5030	NC_015387	CG	3	6	216054	216059	0 %	0 %	50 %	50 %	328949755
5031	NC_015387	CCCCTC	2	12	216065	216076	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	328949755
5032	NC_015387	GC	3	6	216085	216090	0 %	0 %	50 %	50 %	328949755
5033	NC_015387	GCC	2	6	216101	216106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949755
5034	NC_015387	CCT	2	6	216172	216177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949755
5035	NC_015387	TCA	2	6	216183	216188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949755
5036	NC_015387	GAG	2	6	216226	216231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949755
5037	NC_015387	CTCGGT	2	12	216261	216272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5038	NC_015387	GCT	2	6	216273	216278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5039	NC_015387	CGG	2	6	216284	216289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949756
5040	NC_015387	CTG	2	6	216349	216354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5041	NC_015387	TCG	2	6	216395	216400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5042	NC_015387	GCC	2	6	216405	216410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949756
5043	NC_015387	TCC	2	6	216449	216454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949756
5044	NC_015387	G	7	7	216456	216462	0 %	0 %	100 %	0 %	328949756
5045	NC_015387	CTC	2	6	216490	216495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949756
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5051	NC_015387	GCC	2	6	216598	216603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949756
5052	NC_015387	GC	3	6	216664	216669	0 %	0 %	50 %	50 %	328949756
5053	NC_015387	C	6	6	216698	216703	0 %	0 %	0 %	100 %	328949756
5054	NC_015387	TTC	2	6	216709	216714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949756
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5056	NC_015387	CTC	2	6	216724	216729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949756
5057	NC_015387	GAC	2	6	216772	216777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949756
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5059	NC_015387	CGG	2	6	216884	216889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949756
5060	NC_015387	GCC	2	6	216940	216945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949757
5061	NC_015387	GCCCC	2	10	217016	217025	0 %	0 %	20 %	80 %	328949757
5062	NC_015387	TCCC	2	8	217056	217063	0 %	25 %	0 %	75 %	328949757
5063	NC_015387	CG	3	6	217089	217094	0 %	0 %	50 %	50 %	328949757
5064	NC_015387	GCC	2	6	217113	217118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949757
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5069	NC_015387	GCG	2	6	217221	217226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
5070	NC_015387	CGG	2	6	217234	217239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
5071	NC_015387	CG	5	10	217259	217268	0 %	0 %	50 %	50 %	328949757
5072	NC_015387	TCC	3	9	217288	217296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949757
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5074	NC_015387	TG	3	6	217337	217342	0 %	50 %	50 %	0 %	328949757
5075	NC_015387	CCTCGT	2	12	217364	217375	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	328949757
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5079	NC_015387	CGG	2	6	217456	217461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
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5081	NC_015387	CTGG	2	8	217476	217483	0 %	25 %	50 %	25 %	328949757
5082	NC_015387	CGG	2	6	217569	217574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
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5087	NC_015387	CGCGG	2	10	217655	217664	0 %	0 %	60 %	40 %	328949757
5088	NC_015387	GC	3	6	217694	217699	0 %	0 %	50 %	50 %	328949757
5089	NC_015387	TAT	2	6	217903	217908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949758
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5092	NC_015387	GCG	2	6	218061	218066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949758
5093	NC_015387	CAA	2	6	218083	218088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949758
5094	NC_015387	ACA	2	6	218139	218144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949758
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5100	NC_015387	CGG	2	6	218470	218475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949758
5101	NC_015387	CGG	2	6	218530	218535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949758
5102	NC_015387	GTG	2	6	218549	218554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949758
5103	NC_015387	C	6	6	218612	218617	0 %	0 %	0 %	100 %	328949758
5104	NC_015387	CTC	2	6	218630	218635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949758
5105	NC_015387	AGC	2	6	218642	218647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949758
5106	NC_015387	GCG	2	6	218779	218784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949758
5107	NC_015387	TTC	2	6	218804	218809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949758
5108	NC_015387	CG	3	6	218836	218841	0 %	0 %	50 %	50 %	328949758
5109	NC_015387	GGT	2	6	218899	218904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949758
5110	NC_015387	GCC	2	6	218936	218941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949758
5111	NC_015387	CTA	2	6	219091	219096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949759
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5118	NC_015387	CG	3	6	219394	219399	0 %	0 %	50 %	50 %	328949759
5119	NC_015387	GGC	2	6	219418	219423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949759
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5121	NC_015387	TCC	2	6	219459	219464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949759
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5123	NC_015387	G	6	6	219502	219507	0 %	0 %	100 %	0 %	328949759
5124	NC_015387	CTC	2	6	219551	219556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949759
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5241	NC_015387	CG	3	6	223780	223785	0 %	0 %	50 %	50 %	328949764
5242	NC_015387	TAC	2	6	223820	223825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949764
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5244	NC_015387	TAC	2	6	223901	223906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949764
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5247	NC_015387	TCC	3	9	224068	224076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949765
5248	NC_015387	TCG	2	6	224077	224082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
5249	NC_015387	GTC	2	6	224088	224093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
5250	NC_015387	GTC	2	6	224112	224117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
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5252	NC_015387	GTC	2	6	224163	224168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
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5255	NC_015387	CCCGG	2	10	224236	224245	0 %	0 %	40 %	60 %	328949765
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5363	NC_015387	CG	4	8	229130	229137	0 %	0 %	50 %	50 %	328949770
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5367	NC_015387	TGG	2	6	229267	229272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949770
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5491	NC_015387	GAT	2	6	233917	233922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949775
5492	NC_015387	CGCGG	2	10	233929	233938	0 %	0 %	60 %	40 %	328949775
5493	NC_015387	GC	3	6	234030	234035	0 %	0 %	50 %	50 %	328949775
5494	NC_015387	GC	3	6	234126	234131	0 %	0 %	50 %	50 %	328949775
5495	NC_015387	CG	4	8	234195	234202	0 %	0 %	50 %	50 %	328949775
5496	NC_015387	TCA	2	6	234213	234218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949775
5497	NC_015387	GCC	2	6	234260	234265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949775
5498	NC_015387	CAC	2	6	234280	234285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949775
5499	NC_015387	AGC	2	6	234314	234319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949775
5500	NC_015387	CGC	2	6	234351	234356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949775

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